Harmonic Solvation Model (HSM) for Evaluation of Condensed-Phase Free Energy

نویسندگان

چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Efficient evaluation of binding free energy using continuum electrostatics solvation.

The linear interaction energy (LIE) method is combined with energy minimization and finite-difference Poisson calculation of electrostatic solvation for the estimation of the absolute free energy of binding. A predictive accuracy of about 1.0 kcal/mol is obtained for 13 and 29 inhibitors of beta-secretase (BACE) and HIV-1 protease (HIV-1 PR), respectively. The multiplicative coefficients for th...

متن کامل

A generalized G-SFED continuum solvation free energy calculation model.

An empirical continuum solvation model, solvation free energy density (SFED), has been developed to calculate solvation free energies of a molecule in the most frequently used solvents. A generalized version of the SFED model, generalized-SFED (G-SFED), is proposed here to calculate molecular solvation free energies in virtually any solvent. G-SFED provides an accurate and fast generalized fram...

متن کامل

Continuous medium theory for nonequilibrium solvation: I. How to correctly evaluate solvation free energy of nonequilibrium

Considering the influences of electrostatic potential Phi upon the change of solute charge distribution deltarho and rho upon the change deltaPhi at the same time, a more reasonable integral formula of dG = (1/2) integral (V) (rhodeltaPhi + Phideltarho)dV is used to calculate the change of the electrostatic free energy in charging the solute-solvent system to a nonequilibrium state, instead of ...

متن کامل

teacher educator evaluation model

اگرکیفیت معلم کلاس برای بهبودیادگیری دانش آموزحیاتی است،پس کیفیت اساتیددانشجو-معلمان، یابه عبارتی معلمین معلمان نیزبرای پیشرفت آموزش بسیارمهم واساسی است.ناگفته پیداست که یک سیستم مناسب آموزش معلمان ،معلمین با کیفیتی را تربیت خواهدکرد.که این کار منجربه داشتن مدارس خوب، ودرنتیجه نیروی کارماهرتروشهروندبهتربرای جامعه خواهدشد. اساتیددانشجو-معلمان نقشی بسیارمهم را در سیستم اموزش معلمان درسراسرجهان ای...

New solvation free energy function comprising intermolecular solvation and intramolecular self-solvation terms

Solvation free energy is a fundamental thermodynamic quantity that should be determined to estimate various physicochemical properties of a molecule and the desolvation cost for its binding to macromolecular receptors. Here, we propose a new solvation free energy function through the improvement of the solvent-contact model, and test its applicability in estimating the solvation free energies o...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Journal of Computer Chemistry, Japan

سال: 2017

ISSN: 1347-1767,1347-3824

DOI: 10.2477/jccj.2017-0038